UGENE Main Page


9 Июля 2010

Выпущен UGENE 1.7.1

2 Июня 2010

Специальный выпуск UGENE-подкаста: что нового в версии 1.7.0?

19 мая 2010

Выпущен UGENE 1.7.0

2 апреля 2010

Специальный эпизод UGENE-подкастов: что нового в версии 1.6.2?

2 апреля 2010

UGENE на Твиттере

29 марта 2010

Выпущен UGENE 1.6.2

25 февраля 2010

Стартовала серия обучающих видео по UGENE

16 февраля 2010

Выпущен UGENE 1.6.1

22 декабря 2009

Выпущен UGENE 1.6.0

06 октября 2009

Открыта русская версия сайта

22 сентября 2009

Выпущен UGENE 1.5.2

22 июля 2009

Выпущен пакет для PowerPC Макинтошей

17 июля 2009

Выпущен UGENE 1.5.1

July 10, 2009

Выпущен UGENE 1.5

May 13, 2009

UGENE представлен на конгрессе Биотехнология 2009

May 7, 2009

UGENE  становится частью Ubuntu Linux

Unipro UGENE: интегрированные инструменты биолога

UGENE — это свободное ПО для работы молекулярного биолога.

UGENE отлично работает на Windows, Mac OS, Linux и очень прост в установке и использовании. Обладает русскоязычным интерфейсом.


Функциональность:


Основные возможности:
  • Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3,4 и KAlign;
  • Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
  • Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
  • Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
  • Филогенетический анализ с помощью Phylip;
  • Поиск сайтов рестрикции;
  • Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
  • Сборка контигов с помощью Bowtie
  • Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
  • Поиск открытых рамок считывания;
  • Обратная трансляция белков;
  • Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана.

Пользовательский интерфейс:
  • Простая и удобная работа с последовательностями;
  • Визуализация хроматограмм;
  • Редактор множественного выравнивания;
  • Просмотр трехмерных моделей PDB и MMDB с поддержкой стерео-режима;
  • Просмотр филогенетических деревьев;
  • Конструктор вычислительных схем автоматизирующий процесс анализа;
  • Поддержка сохранения изображений в векторные форматы для удобства публикации.

Высокопроизводительные вычисления:
  • Полная поддержка современных многоядерных процессоров;
  • Встроенная поддержка вычислений на графических ускорителях;
  • Вычисления на процессоре Cell Broadband Engine;
  • Суперкомпьютерные и распределенные решения.

Взаимодействие с командой UGENE:
  • Наш продукт может быть использован для обучения в университетах и институтах;
  • Новая функциональность разрабатывается по запросам пользователей;
  • Команда готова к работе над совместными проектами, как открытыми, так и коммерческими.

Доступность:

Unipro UGENE является свободным программным обеспечением, распространяемым по лицензии GNU GPL.

Установочные пакеты для различных операционных систем располагаются в разделе "Файлы".

С нами можно связаться для обсуждения возможного сотрудничества.