Поcледние выпуски подкаста

Подкаст UGENE — это серия обучающих англоязычных видеоматериалов о нашем продукте. Она включает в себя полезную информацию об использовании UGENE, а также содержит ответы на популярные вопросы пользователей. Если вы хотите видеть новые выпуски первыми и в высоком High Definition качестве, просто подпишитесь на наш канал на YouTube или на RSS! Оставляйте комментарии к клипам на YouTube или пишите запросы на нашем форуме, чтобы мы ответили на ваш вопрос в видео-формате!

Вы можете скачать заинтересовавшее вас видео. Для просмотра скаченного видео-файла может быть использован QuickTime Player и другие проигрыватели, поддерживающие MPEG4.

#37: Что нового в UGENE 1.10?

Новый релиз включает множество усовершенствований: новые модули, расширения функциональности, различные улучшения и исправления.

Краткий список наиболее важных новвоведений и улучшений:

  • Новые возможности инструмента для работы с данными секвенирования Assembly Browser:
    • Добавлен новый виджет Coverage Graph для работы с данными секвенирования в Assembly Browser, отображающий точное покрытие последовательности в каждой позиции.
    • Созданы дополнительные способы цветового кодирования коротких последовательностей: визуализация прямой/обратной цепей, парных ридов, и другие.
  • Появилась возможность работы с последовательностями произвольного размера (> 2 Гб) на настольных компьютерах с ограниченным объемом памяти.
  • Созданы элементы для маркировки и фильтрации последовательностей для дизайнера вычислительных схем.
  • В визуализатор последовательностей добавлены графики DNA Flexibility и GC Frame Plot
  • Встроены новые внешние инструменты:
    • MrBayes – построение филогенетических деревьев.
    • Burrows-Wheeler Aligner (BWA) – выравнивание коротких последовательностей (ридов) на референсную последовательность. В отличие от оригинального BWA, работает и для Windows.
  • Также, начиная с этого релиза, UGENE будет распространяться в двух версиях – полной (Full) и стандартной (Standard). Полный пакет UGENE дополнительно содержит набор внешних инструментов и документацию в формате PDF.



#36: Просмотр данных секвенирования (BAM-файлов) с помощью UGENE Assembly Browser

Данное видео представляет собой введение в новый компонент UGENE Assembly Browser, позволяющий быстро просматривать NGS данные. Текущая версия поддерживает BAM и SAM форматы данных.



#35: Основы работы с Дизайнером Запросов

Этот видеоматериал содержит основы работы с Дизайнером Запросов.

Узнайте, как с помощью Дизайнера Запросов совместить работу различных алгоритмов с целью поиска сложных шаблонов на последовательности.





№№1-37: Полный список выпусков
English